勉強用(STAN)

STAN

STANについて勉強しているため、自身の理解のためにソースとかを公開しようと思い立ったので載せていこうと考えております。
10/28:最近STANを使っていませんでしたが, "increment_log_prob(対数尤度)"が "target += 対数尤度"
になっていたり、代入演算子が"<-"から"="に変わるようです。

STANとは

MCMCの中でハミルトニアンモンテカルロ法(HMC)を用いたサンプリングがあり、 STANはHMCを実装するための枠組みのことである。
STANによるサンプリングはコマンドライン(CmdStan)やR言語(RStan),Matlab(MatlabStan),Python(PyStan) などで実行することができる。
また、HMC以外にも変分ベイズであったり、
点推定もオプションとして行うことができる。